NSA: Fiskus zapłaci za własny błąd.

Uzyskanie interpretacji indywidualnej ma zapewniać podatnikowi bezpieczeństwo podatkowe. Co jednak w sytuacji, gdy podatnik zastosuje się do interpretacji, zapłaci podatek, a następnie sąd uzna, że interpretacja została wydana niezgodnie z prawem?

Na to pytanie odpowiedział Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 3 czerwca 2026 r. (II FSK 162/26), zajmując korzystne dla podatników stanowisko.

Stan faktyczny

Sprawa dotyczyła podatnika, który wystąpił o interpretację indywidualną dotyczącą skutków podatkowych sprzedaży działek.

Podatnik zastosował się do otrzymanej interpretacji i zgodnie z jej treścią zapłacił podatek dochodowy. Następnie interpretacja została jednak prawomocnie uchylona przez sąd administracyjny jako niezgodna z prawem. Po ponownym rozpoznaniu sprawy Dyrektor KIS wydał nową interpretację, tym razem potwierdzającą prawidłowość stanowiska podatnika.

W rezultacie okazało się, że podatek został zapłacony nienależnie, a po stronie podatnika powstała nadpłata.

Organ podatkowy zwrócił nadpłacony podatek, jednak odmówił wypłaty oprocentowania za okres, w którym dysponował środkami podatnika.

Stanowisko organów podatkowych

Organy podatkowe argumentowały, że przepisy Ordynacji podatkowej przewidują oprocentowanie nadpłaty wyłącznie w przypadkach wskazanych wprost przez ustawodawcę.

Ich zdaniem katalog tych sytuacji ma charakter zamknięty i nie obejmuje nadpłaty powstałej wskutek zastosowania się do interpretacji indywidualnej, która następnie została uchylona przez sąd administracyjny.

W konsekwencji organy uznały, że zwrot samej nadpłaty jest wystarczający, a podatnikowi nie przysługują odsetki.

Sądy stanęły po stronie podatnika

W pierwszej kolejności rację podatnikowi przyznał WSA w Poznaniu (wyrok z 23 października 2025 r., I SA/Po 422/25). Sąd zwrócił uwagę, że sytuacja podatnika, który zapłacił podatek wskutek wadliwej interpretacji, jest bardzo podobna do sytuacji podatnika, który uiścił podatek na podstawie błędnej decyzji podatkowej.

W uzasadnieniu stanowiska WSA czytamy „Zdaniem Sądu, nie do przyjęcia jest sytuacja, która może stawiać takiego podatnika (jak skarżący), w gorszej sytuacji od podatnika, który uiszczając nienależny podatek w wykonaniu decyzji, następnie uchylonej, ma zagwarantowane z mocy prawa oprocentowanie od dnia powstania nadpłaty. Takie podzielenie podatników, tylko z uwagi na formę aktu administracyjnego, tj. interpretacji indywidualnej zamiast decyzji, w obu przypadkach uznane w rezultacie kontroli za niezgodne z prawem, naruszałoby w konsekwencji konstytucyjną zasadę równości.”

Stanowisko to w całości podzielił Naczelny Sąd Administracyjny.

NSA: podatnik nie powinien ponosić skutków błędu organu.

Naczelny Sąd Administracyjny podkreślił, że ochrona wynikająca z zastosowania się do interpretacji indywidualnej nie może być iluzoryczna.

Zdaniem NSA podatnik, który zaufał organowi i postąpił zgodnie z wydaną interpretacją, nie powinien ponosić żadnych negatywnych konsekwencji późniejszego stwierdzenia jej wadliwości.

W uzasadnieniu NSA wskazał m.in.: „Nie ma podstaw do różnicowania podatników w zakresie ich prawa do jednakowego sposobu liczenia oprocentowania nadpłaty, w zależności od tego w oparciu o jaki wadliwie podjęty przez organ akt dokonali nienależnej wpłaty podatku (interpretacja indywidualna czy decyzja) (…) organ odmawiając prawa do oprocentowania nadpłaty przyznaje sobie prawo do błędu, który nie jest obarczony konsekwencjami”.

Dlatego NSA uznał, że podatnikowi należy się oprocentowanie nadpłaty za cały okres od jej powstania do dnia zwrotu.

Dlaczego ten wyrok jest ważny?

Orzeczenie ma bez wątpienia znaczenie znacznie szersze niż tylko dla podatników występujących o interpretacje dotyczące sprzedaży nieruchomości wzmacnia bowiem zasadę zaufania obywatela do państwa.

W praktyce orzeczenie potwierdza, że podatnik, który działa w zaufaniu do wydanej interpretacji indywidualnej, nie powinien ponosić ekonomicznych skutków błędów popełnionych przez organy podatkowe.

Jak możemy pomóc?

Jeżeli w przeszłości stosowali Państwo interpretację indywidualną, która została następnie uchylona lub okazała się nieprawidłowa, warto zweryfikować, czy istnieją podstawy do dochodzenia oprocentowania nadpłaty.

Wspieramy klientów na każdym etapie postępowań dotyczących interpretacji indywidualnych, nadpłat podatku oraz sporów z organami podatkowymi. Zapraszamy do kontaktu.